Comment les tests antigéniques rapides fonctionnent contre les variantes virales

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Dans une étude, des tests antigéniques rapides ont pu reconnaître les mutations de la protéine N dans les variantes passées et présentes du SRAS-CoV-2, ainsi que plus de 99 % des variantes futures potentielles.

Au fil du temps, de nombreuses nouvelles variantes du SRAS-CoV-2 (le virus responsable de la COVID-19) sont apparues, et on peut s’attendre à d’autres variantes à l’avenir. Les tests antigéniques rapides utilisés aujourd’hui ont été développés sur la base de la souche originale du SRAS-CoV-2. On craint que de futurs variants n’échappent à la détection par les tests antigéniques rapides.

Dans une étude financée par le programme Rapid Acceleration of Diagnostics (RADx®) Tech du NIH, une équipe de recherche a découvert que les tests antigéniques rapides disponibles dans le commerce peuvent détecter les variantes préoccupantes passées et présentes. L’équipe a également développé une méthode pour mesurer la manière dont les mutations virales potentielles pourraient affecter les performances des tests à l’avenir.

Les tests antigéniques rapides détectent les protéines produites par le SRAS-CoV-2, appelées antigènes. Les tests détectent généralement ces antigènes de la même manière que notre système immunitaire – avec des anticorps conçus et fabriqués à cet effet. La plupart des tests antigéniques ciblent une protéine appelée protéine nucléocapside (protéine N). Certains ciblent la protéine Spike. De nombreux tests disponibles dans le commerce utilisent deux ou plusieurs anticorps différents.

À mesure que le virus mute au fil du temps, les acides aminés individuels de la longue chaîne qui constitue la protéine N pourraient être remplacés par d’autres acides aminés. Certains de ces changements pourraient signifier que les anticorps présents dans les tests rapides ne se lieront plus à la protéine.

Les chercheurs ont constitué une énorme bibliothèque de différentes versions de la protéine SARS-CoV-2 N. Leur bibliothèque contenait près de 8 000 substitutions d’acides aminés uniques, représentant plus de 99,5 % de toutes les mutations possibles de la protéine N.

Ensuite, ils ont mesuré comment ces protéines N interagissaient avec 17 anticorps différents utilisés dans 11 tests antigéniques rapides disponibles dans le commerce. Pour chacun des 17 anticorps, les chercheurs ont documenté quelles mutations de la protéine N affectaient la capacité de l'anticorps à reconnaître la protéine.

Les chercheurs ont également testé des tests antigéniques rapides sur des échantillons provenant de patients atteints du COVID-19 qui avaient été infectés par un certain nombre de variantes, jusqu'à Omicron BA.1.

Les résultats montrent que les 17 anticorps utilisés dans les tests antigéniques rapides étaient capables de reconnaître les mutations de la protéine N dans les variantes préoccupantes passées et présentes. Étant donné que les chercheurs ont testé les anticorps contre presque toutes les mutations possibles de la protéine N, les tests rapides devraient également pouvoir reconnaître les futures variantes virales. Les tests rapides ont également fonctionné sur des échantillons provenant de patients présentant des variantes connues du SRAS-CoV-2.

Les tests antigéniques rapides sont un outil important pour ralentir la propagation du COVID-19. Lorsque les gens savent qu’ils sont infectés, ils peuvent prendre des mesures supplémentaires pour éviter de transmettre le virus à d’autres. Les informations de cette étude peuvent aider à repérer les tests qui pourraient ne pas reconnaître une nouvelle variante particulière du SRAS-CoV-2.

Les chercheurs ont examiné les effets de mutations individuelles, mais de nombreuses variantes préoccupantes présentent de multiples mutations de la protéine N. Des recherches futures pourraient évaluer comment plusieurs mutations de la protéine N affectent la capacité des anticorps à reconnaître la protéine.

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Frank, F., Keen, MM, Rao, A., Bassit, L., Liu, X., Bowers, HB, Patel, AB, Cato, ML, Sullivan, JA, Greenleaf, M., Piantadosi, A., Lam, WA, Hudson, WH et Ortlund, EA (2022). L'analyse mutationnelle approfondie identifie les mutations d'évasion de la nucléocapside du SRAS-CoV-2 des tests antigéniques rapides actuellement disponibles. Cellule, 185(19), 3603-3616.e13. https://doi.org/10.1016/j.cell.2022.08.010